Den centrala delen i förbundets utbildningssystem består av en trefasig teoretisk navigationsutbildning. Navigationsförbundets medlemsföreningar anordnar Skärgårds-, Kust- och Högsjökurser, ofta i samarbete med medborgar- eller arbetarinstitut. Som lärare på kurserna fungerar lärare som är auktoriserade av Navigationsförbundet. 

Förutom teoretiska navigationskurser arrangerar vissa föreningar även CEVNI- , radar- , elektronisk navigations- och praktiska båtförarkurser.

Navigationsförbundet främjar säker fritidsbåtsnavigering genom att publicera läromedel. Du kan beställa läromaterial från navigationsbutiken!

När du har gått en navigationskurs kan du delta i examen. Du kan också studera inför examen på egen hand. Examen hålls fyra gånger om året, och du kan anmäla dig via din lokala navigationsförening.

Efter en godkänd examen kan du beställa ett intyg eller diplom från Navigationsförbundet. Du behöver intyget eller diplomet för att ansöka om ett internationellt förarbrev för fritidsbåt. Du kan beställa intyget eller diplomet i samband med att du deltar i examen, eller när som helst efter en godkänd examen.